تختص إدارة التدقيق الداخلي بما يلي:

• وضع مشروع خطة التدقيق السنوية على الوحدات الإدارية بالمجلس، ورفعها للرئيس لاعتمادها، وإعداد تقارير بنتائج التدقيق.
• 
  
• مراقبة مدى الالتزام بتنفيذ القوانين واللوائح والقرارات المتعلقة بأنشطة المجلس.
• 
  
• مراقبة المستندات المالية من سندات قبض وسندات صرف وسندات قيد وغيرها، بعد الصرف.
• 
  
• مراجعة التعليمات المالية، واقتراح ما يلزم لها من تعديلات، ومراقبة تنفيذها.
• 
  
• مراقبة إجراءات تعيين الموظفين، وإجازاتهم، وترقياتهم، وغير ذلك مما يتعلق بشؤون الموظفين، والتحقق من الالتزام بالقوانين واللوائح والقرارات المنظمة لذلك.
• 
  
• التأكد من سلامة الأموال والعهد والأثاث والأدوات والمباني والموجودات الأخرى التي يملكها المجلس أو تخضع لإشرافه.
• الاشتراك في جرد محتويات المخازن والعهد الأخرى. ​
  ​
  ​
  ​